大熊猫的主食是竹子，但发表在mBio1的最新研究发现，熊猫的肠道微生物并不擅长分解植物纤维。熊猫的肠道微生物更接近于食肉动物而不是食草动物。

古代大熊猫最初是一种杂食动物，大约在700万年前将竹子加入到其饮食之中，240万到200万年前开始将竹子作为主食。它演化出强有力的颚和一个“假拇指”帮助食用植物。但与其它食草动物不同的是，熊猫没有发展出长消化道或酶去帮助分解植物的坚硬部分。

为了研究熊猫的内脏微生物，中国研究人员测序了来自45只不同年龄的熊猫的粪便中的核糖体RNA，与其它哺乳动物如熊和马进行比较，发现熊猫的内脏微生物缺乏多样性，没有发现食草动物常见的纤维素降解菌。