上信息的好坏直接影响硬盘驱动器能否正常工作。如果使用不当或某种意外的原因破坏了写在00磁道上的文件，那么，开机以后，C盘就无法引导操作系统，甚至发生磁头根本无法寻道进行文件读写。此时C盘就像未经格式化似的，因此当用户调用C盘时，屏幕就显示“无效的驱动器指示”。排除这种故障的方法是重新对C盘进行物理格式化、重新进行操作系统分区和重新对DOS区域进行格式化并拷入系统文件。
　　因为硬盘有两个引导记录（假定硬盘被分为一个分区），一个是主引导记录，一个是分区引导记录。主引导记录的清除和重新写入可以使用物理格式化（低级格式化）程序（LOW—FORM.EXE、DTCFMT.EXE），因而前面所述排除故障的过程中，首先使用了物理格式化。第二步是使用DISK.COM对硬盘进行分区并把分区信息登记在主引导扇区中，但它并不改变主引导记录的执行代码。第三步使用FORMAT.COM对DOS 区域进行格式化，由于主引导记录不属于任何分区，因而FORMAT.COM程序不能清除主引导扇区中的任何信息。在上述三个步骤完成以后，再将操作系统的系统文件写入硬盘，至此，重新生成硬盘的工作才算完成，这时，硬盘驱动器已经具备了自举的能力，可以使用了。
　　当用软盘驱动器A引导操作系统以后，可以显示硬磁盘中的文件目录，但不能从硬盘驱动器引导操作系统。
　　出现这种情况一般是由于系统文件没有写好或损坏。操作系统文件一共有三个部分组成，即两个隐含文件和一个COMMAND.COM文件。两个隐含文件是写在00道上的，一旦出现故障，则主机不能引导操作系统。
　　排除故障的方法是，使用FORMATC：/S/V命令重新对硬盘进行一次格式化，然后把备份的用户文件拷贝回硬盘即可恢复使用。