5年后，王晓晔当年担忧的问题依然存在。国务院反垄断委员会专家组的副组长黄勇在接受记者采访时说，“在反垄断方面，这几年来三家机构作出了各自的成绩，但是专业性和统一性的问题有待解决，我国反垄断的现状是一部法律落到了三个执法部门”。但是，企业在经营行为中，涉及价格、间接的价格或者非价格的限制都有可能同时出现，那么这时就存在着谁该管、谁先管、谁后管的问题，存在着相互之间调查的协调及处罚的协调问题。”

不过，记者采访的几位部委执法机构工作人员均表示，目前三个部门的分工明确，在实际工作中还未遇到有交叉办案的情况，也没有什么具体协作。

一位不愿具名的部委人士给记者举例说明了三家反垄断机构共同执法带来的烦琐。“三家部委，每个都有对外合作处，所以我们与国外签订反垄断合作协议，就得三个机构分别对外方签。跟美国签订‘3+2’（美国反垄断两个执法机构），跟韩国签订‘3+1’。”他说，“如果三个执法机构能合并成一个统一机构，在合作办案上则会方便快捷很多。”

除了浪费行政资源、拖累效率之外，中央党校教授周天勇认为，这个体系的直接弊端，或在于强化了部门利益之争。他说：“交叉执法可能存在这种问题，能够行使权力和获得利益的时候，各个部门都希望能插手，没有利益而需要负责任的时候，部门之间相互推诿。”

周天勇建议，发改委应该独立于反垄断执法部门。“我一直认为，作为宏观调控部门，发改委在反垄断工作上应更多地发挥政策和宏观指导的作用。